结构调整难度大
虽然很多的人有这种想法，人大代表也提出了这个建议，但是教育部的回应并没有表示支持，因为各个地方的经济落差大，他们更多的是考虑到了一个整体的改观。尤其是相对落后的地方，也是十分地难以实现。
他们更重要的是对基础知识的教育与学习，而民办学校在我国某些地方还是很多，这也为实现九年义务教育延长的公益性，有一定的阻碍作用。纵使教育部想要延长，可各个方面的需求的标准达不到，只能在未来再策划。
人民建议虽好，但经济跟不上
虽然越来越多的人建议将九年义务教育改成十二年义务教育，但是在教育部门所看来这在短时间里很难实现，我国正处于发展中国家，经济实力还不是很强，所用在教育上的费用也不是很多，尤其是在高中阶段更难使其成为义务教育。
经济压力过大也让这个建议无法实现，虽然人民只考虑到孩子的学业方面，而对于教育部来讲，这个方案实施它还需要各个方面的考虑，综合来决定能否成功实现九年义务教育的延长。
地区性差异，落实情况较为困难
每个地方的民办学校还是有很多的，一旦将教育改革成十二年义务教育，就很难实现教学的统一化，从而无法更好地提高教学水平。
除此之外，现在的教育大多看中于基础知识的教育，落实十二年义务教育之前，将会有很长的时间进行基础教育的学习，这也是教育部所想到的，因此才不会支持代表的建议，还说出了不实施的理由。
