该校前身是1948年的“东北民主联军南岗干部子弟学校”，1950年易名为“中国人民解放军第十五兵团干部子弟学校”，后更名为“广州市第53中学”。1981年，更名为“广州师范学院附属中学”。2001年，更名为“广州大学附属中学”。
截至2021年2月，广州大学附属中学设有黄华路、大学城2个校区。
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