单交换和双交换的交换次数不同。单交换是两个连锁基因间只发生一次交换；而双交换是两个连锁基因间发生两次交换。具体区别解释如下。
----A----B-----C-----
----a----b-----c-----
AB和ab之间的DNA断裂，上面的A连接到下面的DNA上，下面的a连接到上面DNA上，得到以下结果。
－－A----b－－－c－－－
－－a－－B------C------
由于上下是可以颠倒的，没有关系，染色体不存在说谁一定要在上。这就是单个基因座的交换。上面的交换，只有A这个基因座交换了位置，所以是单交换。
如果是
----A----B-----C-----
----a----b-----c-----
变成
----A----b-----C-----
----a----B-----c-----
这个就是个双交换了。以B基因座为参照，看它两边的基因座都交换了。以A为参照，右边的都交换了，所以是双交换。
