学校学科体系完整，办学特色优势明显。学校现有4个一级学科博士学位授予点、13个一级学科硕士学位授予点、7个学位授予点、3个博士后科研流动站。学校现有44个本科，覆盖工学、理学、农学、经济学、管理学、法学、文学等多个学科。
国家特色专业5个，国家级一流本科专业7个、上海市一流本科专业14个。植物与动物科学、农业科学、生态学进入ESI国际学科排名全球前1%，水产学在全国第四轮学科评估中获A+评级，全国排名第一。
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