平行志愿中，同一批次所报的各院校均为第一志愿，所以平行志愿没有“院校级差”的存在。而顺序志愿在同一批次所报的各院校分第一志愿，第二志愿.......等等。很多院校会设置院校级差，更有甚者，不录取非第一志愿考生。
在平行志愿中，考生可以报ABCDE五所院校，对于院校方来说，是不可能知道考生具体在ABCDE中的哪一个志愿报的自己学校。而在顺序志愿模式中，院校方是非常清楚，考生具体在第几志愿报的自己院校。
平行志愿模式中，考生一旦被退档，就只能参加本批次的征集志愿，或下批次的投档录取，但在顺序志愿中，考生同一批次的第一志愿被退档还可以继续参加第二志愿所报院校的录取。所以，平行志愿模式一旦被退档，后果比顺序志愿被退档的后果更严重。
